ここで、自民党の派閥について３つ補足しておきたい。
①自民党の中で優位にあった自由党系であったが、優位派閥であった竹下派が小渕派と羽田・小沢派に割れた。後者が党外に出た後、小さかった小渕派は、第１派閥の地位を取り戻すことに成功した（竹下ら実力者が残っていた事や、橋本龍太郎に一定の人気があった事により、総裁・総理大臣のポストを得たことが大きい。自民党の中心にあることで、新人や復党希望者を多く吸収したのであった）。小泉内閣の成立後、第２派閥には留まっていたにもかかわらず、この派閥が弱っていった背景には、ベテラン・中堅が多くなかったこともあるのだろう（自民党を見限って離党したものの復党した議員は、たとえベテランであっても党内で力を持つことが難しかった。なお、現在同派は、小派閥であったはずの麻生派に抜かれて第３派閥になっている）。
同じ自由党系の、優位派閥ではなかったが、順調に総理を出してきた池田派の系譜も、河野グループの離脱、加藤の乱による分裂（離脱者が堀内派、残留した少数派が加藤派）で弱体化した（河野グループは弱小派閥であったが、トップが安倍晋三と親しい麻生太郎になり、安倍が再度総理になると、どんどん強くなっていき、主要派閥の中では小さかった三木派の系譜―三木派→河本派→高村派→大島派→山東派―を吸収した）。
②１９９８年、自民党内のほぼすべての派閥が分裂した（他派閥より小さかった三木派→河本派→高村派を除く。同派は後に麻生派に吸収された）。その分裂とは、そのころまで連立を組んでいた社民党とさきがけ、そして与党ではなかったが、その両党から生まれた民主党系との間にパイプがある勢力と、それらの政党よりも保守色の強い新進党（の小沢一郎ら→後に自由党）と「保・保連合」を組もうとした勢力である。後者の中には、社会党→社民党との関係が良好であったものの、自派の主導権争いに破れて反自社さ派となった亀井静香、河野洋平がいた。
分裂を整理すると次の通りだ（より詳しくは「起こり得る、「保革連立」の再来」参照）。
・小渕派→小渕派と梶山清六、菅義偉らわずか３名で派閥を離れたが、梶山は小渕派の要人であった）
・三塚派→森派と亀井派
・宮沢派→加藤派と河野派
・渡辺派→山崎派と中曽根派
それぞれ前者（小渕派、森派、加藤派、山崎派）が自社さ派、後者が保保派であったが、社さ両党が連立を離脱し、民主党も野党色を強め、ついには新進党分裂の影響で野党第１党になると、自社さ派は単なる主流派に、保保派が単なる非主流派となった。「自社さ派」は公明党と組みたかったからではあっても、保保派のパートナーとなるはずの自由党（新進党をほぼ独断で解党した小沢が結成）と組んだ。この変化、そして総裁選に出馬して同じ自社さ派であった小渕（小渕派→橋下派）に敗れたことで、加藤派、山崎派は、単に主流派となった「自社さ派」を離れた。ただし、加藤派の多数派は、加藤の乱（『政権交代論』「高支持率の小泉内閣と、その限界」参照）をきっかけに加藤派を離脱、堀内派を結成して、主流派に残留した。これは２０００年の事で、その前年の、加藤、山崎の双方が敗北した総裁選では、自由党との連立も実現しており、主流派に付かざるを得なくなった非主流派も、小渕を支持していた。
③自民党は小渕→橋本派を中心に、総主流派体制になったが、加藤派と山崎派は、一度裏切った勢力として、非常に肩身が狭くなった（山崎、山崎派に関しては、盟友の加藤を見捨てなかったこと、小さな派閥とはいえ、加藤派のように分裂しなかったことで、あまり評価を下げなかったようである―補足すると、山崎派は山崎が渡辺派を割って立ち上げた派閥であったが、加藤派は、加藤が宮沢元総理から継いだ名門派閥であり、加藤の好きなようになるわけではなかった―）。そして２００１年、総裁選で小泉（森派）が橋本（橋下派）を破ると、小泉は優位派閥の地位を取り戻しつつあった橋本派を冷遇し、以後自民党は、森派の系譜が優位派閥となる。２００１年の総裁選は、国家議員票で特に、橋本の優勢が予想され、橋本勝利の予想が多かった。しかし、自民党の不人気ぶりに動揺した党員が、党内力学を無視して小泉に流れたことで、状況が変わったのであった。